У меня есть проблема с сылками на скачивание,большенство ссылок как бы не рабочие! при нажатие на ссылку Downlod master скачивает фаил Index.php подскажите как решить эту проблему! Искал на форуме не нашол.

Эта проблема не нова. Скачивайте обычным способом не используя его. Я давно отказался от этой программы , на многих сайтах тоже самое и пользуюсь Хромом или Лисом без применения программы Downlod master.
Также об этом написано здесь: /forum/